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[NGS]SAM/BAM ~ align ~ tablet/VCF format

sam file document 는 구글에 sequence alignment map format specification 검색하면 쉽게 찾을 수 있다.sam 파일의 각 열에 대한 설명이다. 10,11은 염기와 퀄리티 점수를 갖고 있으므로 반대로 fastq 파일을 만들 수 있다. FLAG는 SAM/BAM 파일에서 각 read의 alignment(정렬) 상태를 2진수 비트(bit)로 정의하고 십진수로 변환한다. 여러가지 상태인 경우 모두 합산한 값으로 구한다. 합산값은 고유하다. samtools를 이용하면 FLAG로 리드가 어떤 상태와 특성을 갖는지 확인할 수 있다. Samtoolshttps://www.htslib.org/ SamtoolsSamtools Samtools is a suite of program..
bioinformatics 2025. 5. 10. 23:17
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