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biotechknowledge
대학원생활 1달차 느낀점을 정리해보고자 한다. 피곤하고 일요일저녁이라 쓰기 굉장히 귀찮아서 대충 생각나는대로 휘갈길 예정이니 감안해주세요. 1. 양질의 세미나서울대학교에와서 좋은 점 중 하나는 질 좋은 세미나를 매주 들을 수 있다는 것이다. 아직 학생등록이 안되어서 받지 못한 세미나 메일이 많아서 다 듣지 못하는게 아쉽다. 바이오뿐만 아니라 인문학,음악 등 다양한 분야의 세미나가 열리고 무료로 들을 수 있다. 이번주에는 2024 노벨화학상 알파폴드 연구실에서 연구하셨던 교수님이 오셔서 강의 해주시고 갔다. 저번 주에는 cancer genomics 강의를 들었는데 너무 재밌게 감동적으로 들었다. 이런 강의의 특징은 오랜 경험을 지닌 해본사람만 아는 노하우를 전달 받을 수 있다는 것이다. 검색해도 나오지않는..
SKN AI 캠프에서 만난 친구들과 Dacon 대회에 참가하였다. 우연히도 바이오데이터를 활용한 인공지능 대회가 있었고 배경지식을 이용해서 AI 적용해볼 기회를 가질 수 있었다. 나는 주로 데이터 전처리를 담당했고 팀원들이 다양한 머신러닝 기법을 적용해보면서 성능을 끌어올리는데 집중했다. 간단하게 데이터와 어떤 방식으로 접근하고 발전시켰는지 정리해 보겠다. 먼저 주어진 데이터이다. 데이터를 보면 아미노산 변이정보가 HGVS (Human Genome Variation Society) 표기법으로 나와있다. 정상인은 WT(wild type) 변이가 생긴것은 어떤 아미노산이 어디 위치에서 어떤 아미노산을 바꼈는지 나타낸다. 예를들어 R895R은 아미노산 R이 895위치에서 아미노산R로 변이된 것. 즉 침묵돌연..