본문 바로가기

전체 글

(58)
SKN AI bootcamp 5기 1주차 화요일부터 금요일까지 4일 파이썬 수업을 들었다. 설렘 반, 걱정 반으로 6개월 과정의 첫째 주를 보냈다. 시작하기 전, 비 전공자들은 따라가기 굉장히 힘들다는 얘기를 들었다. 그래서 도중에 포기하고 나가는 사람들도 있다고 들었다. 파이썬은 혼자서 아주 기본적인 부분은 듣고 온 터라 첫째날은 괜찮았다. 한달? 두달 쯤에 올줄알았던 위기가 벌써 왔다. 둘째날부터 수업 내용이 급격하게 많아지고 먼 통학거리에 복습할 시간이 부족했다. 이대로가면 무조건 낙오할 것 같다는 느낌이 와서 독산역 근처에 방을 잡고 6개월동안 공부하고 코딩하면서 이악물고 버틸 생각이다. 다음 주 시작이 두렵지만, 잘 할수 있을 것이다. 수업에 치이고, 왕복 4시간의 통학시간에 치이고 복습하기 바뻐서 회고록을 뒤늦게 일요일 밤에 쓰게 됐..
이것이 SQL 이다 MySQL Workbench 구글,엣지로 서버에 접속하듯 DB서버에 접속하는 프로그램예약어는 대문자로 쓰자. ex) SELECT, FROMMySQL 번개모양(실행) 누르면 모든 라인 명령어가 실행되기 때문에, 실행시키고 싶은 라인만 드래그하여 누르기 > 나중에 데이터를 변경/삭제 하는 명령어라인까지 중복실행되면 DB가 엉망이 될 수 있다.명령어 수행 후 바로 적용이 안될 수 있다. (create table 같은 경우) 그럴 땐 refresh 하기.DB백업은 같은 드라이브에 하는 것이 아니라 별도의 드라이브나 네트워크환경에 한다.웹서버와 데이터베이스 서버; 웹 서버는 웹페이지와 애플리케이션을 호스팅하고, 데이터베이스서버는 MySQL과 같은 데이터베이스 관리 시스템을 싱행하여 데이터를 처리.MySQL을 설치..
생명정보개론(bioinformatics) - Genebank,SNP 유전자 검색 이 포스트는 K-MOOC 의 생명정보개론 강의를 들으며 정리한 것으로 공부하면서 생겼던 의문점을 함께 정리하였습니다.   Location : X 염색체 q25번 위치에 존재Exon count : 이 유전자가 전사되고 스플라이싱 과정을 거친 후, 10개의 엑손이 포함된 mRNA가 생성됨.Annotation release 와 Assembly의 관계각 Annotation release는 특정 Assembly 버전을 기준으로 유전자의 위치를 설명한다. 예를 들어 Rs_2023_10이라는 주석은 GRCh38.p14 및 T2T-CHM13v2.0을 기준으로 하고 있으며, 이전 주석 데이터(105.20220307)는 GRCh37.p13을 기준으로 한다.     Exon 과 Coding Sequence(CDS) 의 개념..
생명정보개론(bioinformatics) - SNP, dbSNP 이 포스트는 K-MOOC 의 생명정보개론 강의를 들으며 정리한 것으로 공부하면서 생겼던 의문점을 함께 정리하였습니다. 변이 데이터베이스-2001년에 진행돼었던 human genome project 때 밝힌 인간의 DNA를 기준(reference)으로 삼는다. SNP(Single nucleotide polymorphism) DNA 염기서열에서 하나의 염기서열(A,T,G,C)의 차이를 보이는 유전적 변화 또는 변이를 단일 핵산염기 다형현상(SNP)라 한다. 여러사람들에게 공통적으로 나타난다면 (polymorphism) 이라 한다. Q.어느 개인에게 SNP가 발견되었을 때, 그것이 질병을 일으키는 변이인지, 아니면 단순한 개인의 특징을 결정하는 변이인지 구분을 어떻게 하는가?A. 데이터 베이스 참조 (Clin..
생명정보개론(Bioinformatics)- NGS개념, 분석원리 이 포스트는 K-MOOC 의 생명정보개론 강의를 들으며 정리한 것으로 공부하면서 생겼던 의문점을 함께 정리하였습니다.  생명정보학의 이용-난치병의 치료하는데 생명정보학(차세대 염기서열 분석법)의 도움을 받을 수 있다.-Nic Volker 어린이의 난치병을 진단하기 위해 생명정보기술이 사용되었다.-수천개의 염기서열 중 단 하나의 염기치환을 발견하여 병명을 특정하고 올바른 치료를 받을 수 있었다. 문헌 데이터베이스-Pubmed 와 Google Scholar 를 사용한다.-Google Scholar 본문내용까지 검색가능, 인용횟수와 인용논문을 확인할 수 있다. 차세대 염기서열 시퀀싱(Next Generation Sequencing)-인간의 DNA는 30억개의 염기쌍으로 되어있다. 그 중 의미를 단백질을 코딩하..
Rocky9 rinux 설치 trouble shooting : Failed to find a suitale stage1 device: 파티션 나누기 완료가 되지 않을 때 File system 에서 EFI System Partition 으로 변경 후 해결 파티션 나누기 실패 again/ 파티션을 나눌때 30GB가 아닌 30MB로 설정되어 문제 발생 → 30G로 수정 후 완료
Asia pacific storke conference in hongkong
Japan & Korea joint stroke conference In busan (+poster presentation award)